如果要做亲子鉴定的话，就必须要明确你想鉴定的是谁与谁之间的关系，那么，关于亲子鉴定是和父亲做还是和母亲做的问题也就能迎刃而解。一般来说，孩子都是由母亲所生的，自己怀胎十月辛辛苦苦生下的孩子不会出错。如果有些母亲担心自己的孩子在出生以后会出现抱错的情况，那么这个时候跟母亲做亲子鉴定也是可以的，这样鉴别出来的结果就是母亲和孩子之间是否存在亲子关系。通常大部分的人选择还是和父亲进行亲子鉴定，这主要还是看个人的需求。但这并不意味着只能够和父亲进行亲子鉴定，如果只跟父母中的一方进行亲子鉴定的话，那么就为二联体亲子鉴定，这样的鉴定结果可能会存在单亲的风险。为了保险起见，进行父母子三人的亲子鉴定，可能会更好一些。