DNA亲子鉴定自2000年以来，所使用的仪器和试剂逐渐向标准化过渡，如现在大多数亲子鉴定中心使用的ABI公司生产的毛细管测序仪(也叫遗传分析仪)，其中310、3100、3130这几种型号的遗传分析仪，样本电泳时使用的胶，还有检测样本时使用的荧光标记试剂盒都是通过FDA认证。这种认证，保证了仪器和试剂的稳定性和可靠性。  

但是，由于毛细管测序仪价格相对比较昂，也有一些鉴定中心还在采用更初的银染试剂和聚丙烯胺凝胶电泳进行检测。用银染法DNA鉴定，所得结果要在聚丙烯酰胺凝胶进行电泳，而聚丙烯酰胺凝胶的分辩率没有测序仪高，有时无法分辨相差1-2个碱基的位点，而且银染法所用的仪器和试剂没有经过认证，因此结果很难保证。  

在DNADNA技术诞生以前，还有一些传说中的亲子鉴定方法，如滴血认亲、滴骨验亲等等，这两种方法没有什么技术含量，也不需要用到复杂的仪器设备，即使是非*学的平民百姓，也可以完成鉴定。不过，经DNA医学证实，滴血认亲和滴骨验亲均缺乏科学依据，准确性也不敢恭维，于是早已被社会所淘汰。