一、dna比对是什么意思

序列比对综合分析

用来对核酸与蛋白序列进行多序列比对（multiple sequence alignment）的软件。

。将一条序列与另一条序列进行比较或在数据库中查找同源序列并输出。

分成五个不同的程序，分别为：blastp(蛋白质序列，在蛋白质序列数据库中查序列)、blastn(核酸序列，在核酸序列数据库中查找同源序列)

blastx(核酸序列，在蛋白质序列数据库中查找同源序列)、tblastn (蛋白质序列，在核酸序列数据库中查找同源序列)、tblastx(核酸序列，在核酸序列数据库中查找同源序列)。

当对两个核酸序列进行比对时，K-Estimator用来评估两者核苷酸替代数（趋异性），包括蛋白编码与非蛋白编码。

BioEdit是一个序列编辑器与分析工具软件。7.0.1中文汉化版。

Jalview为用Java语言写的多序列比对编辑器。

这只水母不简单，可以用来进行DNA翻译，序列比对，限制酶消化，序列进行BLAST，研究项目管理等。

PROcessor of SEQuences的缩写，是一个核酸序列编辑与种群遗传学分析软件。

为Sequence Manipulation Suite的缩写，是DNA与蛋白序列分析与格式化在线工具的集合。

Staden软件包是UNIX系统下的非常有名的综合序列装配、编辑、分析软件包，此为更新开发的WINDOWS版。

NCGR(National Center for Genome Resources) 开发的用JAVA语言写成的数个不同类生物信息软件与数据库的软件集合平台ISYS。

用来显示与研究相类似的基因与蛋白序列之间的进化关系的软件。

java语言编写的核酸或蛋白序列图像显示、比对软件。

序列比较分析软件Blast的扩展软件，由作者安康农业张巨源授权提供。

基于Smith-Waterman算法的序列比对软件，JAVA语言写成。

多功能综合序列分析软件演示版，可免费使用一段时间。软件购买价格789美元。

双序列比对图形显示软件；

用来处理、显示比对结果的软件；

本地序列比对工具软件 。

包括三维显示软件Ambrosia和比对结果显示软件cinema的软件；

免费的DNA和蛋白序列编辑管理软件

多序列比对统计和进化分析软件

显示分析多种类型的遗传数据软件

开放源代码的序列分析软件包

结构生物信息学Python平台

JAVA语言开发的生物信息学工作平台软件

简单的结构和序列比对软件

综合生物信息学工具软件

重组和突变相关比对分析软件

用于DNA序列资料的常规分析软件

序列分析工具blast+ 、muscle和blat图形界面程序

以上软件，除特别注明外，均在生物软件DVD光盘2中。

二、如何进行dna比对实验

输入原始序列或FASTA格式序列，长度限定在2000以内

>sequence one

gcgcgtgcgcggaaggagccaaggtgaagttgtagcagtgtgtcagaagaggtgcgtggc

accatgctgtcccccgaggcggagcgggtgctgcggtacctggtcgaagtagaggagttg

输入原始序列或FASTA格式序列，长度限定在2000以内

>sequence two

gacttgtggaacctacttcctgaaaataaccttctgtcctccgagctctccgcacccgtg

gatgacctgctcccgtacacagatgttgccacctggctggatgaatgtccgaatgaagcg

使用此工具之前，请详细了解浏览器兼容性 要求。

Use the following parameters to specify how alignments are scored。

匹配的 6

4

3

2

0

-1

-2

-3

-4

-5

-6分

错配得6

4

3

2

0

-1

-2

-3

-4

-5

-6分

前置Gap得6

4

3

2

0

-1

-2

-3

-4

-5

-6分

内部Gap得6

4

3

2

0

-1

-2

-3

-4

-5

-6分

后置Gap得6

4

3

2

0

-1

-2

-3

-4

-5

-6分

三、如何进行dna比对分析

DNA比对是对于分子生物学专注研究生来说是更常用的方法之一，对于利用软件来讲在NCBI上比对比较简单快捷，并且很直观的展现差异化，便于以后对该基因的后续研究做铺垫

工具/原料

基因序列、NCBI、

方法/步骤

2

在网站的右侧找到BLAST选项并点击进入

2

3

在Basic Blast内找到核酸blast并点击进入

4

在输入查询的对话框中打入目标序列， 勾选Align two or more sequences,可以输入两个以及三个以上的序列选项进行对比

把两段或者两段序列输入后，点击Blast进行比对，这时需要等几秒时间

6

等待几秒后得到比对结果，如图所示，可以得到基因大小、序列比对信息、

END

经验内容仅供参考，如果您需解决具体问题(尤其、医学等领域)，建议您详细相关领域专注人士。

作者：本篇经验系本人依照真实经历原创，未经许可，谢绝转载。

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