亲子鉴定是学STR分型检测方法在生活中的应用。STR-(short tandem repeat,短片段重复序列)广泛存在于人类及哺乳动物的基因组中,具有高度多态性,它们一般由2-6个碱基构成一个心序列,心序列串联重复排列,由心序列重复数目的变化产生长度多态性。那么DNA分型理想的STR基因座标准是?
目前在人基因组中已发现8000多个STR基因座,但不是所有的STR基因座都适用于学检验应用。从实用价值考虑,检验用STR基因座应具备以下特点:
1、等位基因片段长度在95-500bp范围,更好在bp以下;
2、具有较高的杂合度以及个人识别能力,一般杂合度在70%以上,DP>0.90;
3、重复序列结构简单,不含有较高都可变的重复单位序列,较少或没有插入等我基因。更好是具有规律的四苷酸或五苷酸重复序列;
4、等位基因数10-12个,等位基因易于分;
5、当与其他基因座复合扩增时,重复性好;
6、突变率低,不超过0.02%;
7、具有高度种属特异性。
个Y-STR基因座在亲子鉴定中的应用研究
作者:邓志辉 李茜 吴爽 李大成 杨宝成y染色体短串联重复序列非父排除率基因突变亲子鉴定
:本研究探讨AmpHSTR Yfiler^TM复合扩增系统中的个Y—STR基因座在学亲子鉴定案检实际工作中的非父排除能力,以及在国内人群中的基因突变情况。采用业已经ReliageneY—PLEX^TM6和本实验建立的“9个短片段长度Y—STR复合扩增系统”检测的36对非父子和84对真父子,用Yfiler^TM试剂盒进行PCR复合扩增.PCR产物用ABI3100基因测序仪基因扫描方法检测和分析;统计每一非父子对中排除亲子关系的Y—STR基因座的个数,观察真父子对中Y—STR基因座基因突变情况;并与以往采用RefiageneY—PLEX^TM6系统和“9个短片段长度Y—STR复合扩增系统”的检测结果进行对比。结果表明:Yfiler^TM系统检测36对非父子,其中1对非父子不能排除,其余35对均有3个以上Y—STR基因座可以排除亲子关系;有3个以上Y·STR排除的非父子对占97.22%(35/36),高于Y—PLEXTM6系统的92.11%(35/38)和“9个短片段长度Y—STR复合扩增系统”的91.67%(33/36);除1例Y—STR不能排除的非父子对外,其余的35对平均每一非父子对有11.3个Y—STR基因座可以排除亲子关系。Yfiler^TM系统检测84对真父子.观察到DYS437、DYS439、DYS635、DYS389Ⅱ和DYS等5个基因座各出现1次基因突变事件,均表现为相差1个心序列,每一基因座每次减数分裂的平均突变率为3.50×10^-3;Y-STR基因突变案例占检测案例的5.95%(5/84).高于Y—PLEXTM6系统的2.%(2/93)和“9个短片段长度Y-STR复合扩增系统”(0/84)。:Yfiler^TM系统检测的Y—STR基因座较多,在亲子鉴定实践中具有较高的非父排除能力,但该系统的基因突变问题不容忽视。
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